Learning Objectives of Webinar

• Principle and benefits of NGS-based chimerism testing

• Ease of use and workflow overview

• Performance specifications when using AlloSeq HCT

Curt Lind는 CareDx Lab 제품 사업 부문 R&D 책임자이며, 조직적합성과 면역유전학 분야에서 25년 가까이 종사해 왔습니다. 그는 NGS 기술 활용에 주안점을 두고 이식 진단 제품의 개발과 상용화를 주도하며 다양한 임상, 연구, 상업적 역할을 맡았습니다. Curt는 2020년 CareDx에 합류해 현재 HLA typing 및 이식 surveillance 제품의 설계, 개발 및 상용화를 위한 R&A를 총괄하고 있습니다.

Recipient의 gDNA를 Blood, Bone marrow등에서 추출하여 Amplicon 방식으로 202개 SNP을 Target하여 Illumina용 Library prep을 진행하게 됩니다.

Input gDNA양은 10ng 이상으로, 적은 양의 gDNA로도 실험 가능한 것이 장점이며, 2시간 이내 짧은 Hands on time과 총 분석시간 24시간(Sequencing시간 포함) 이내로 분석 가능합니다. 

AlloSeq HCT is reproducible with high quality data 

Internal validation의 결과 ~0.3%까지, external validation결과 ~0.1%까지의 Sensitivity를 보였습니다.

이러한 Sensitivity를 바탕으로 기존 STR 검사에서 분석이 어려운 Low-level mixed chimerism detection이 가능하며,  Early stage relapse detection을 할 수 있습니다. 또한, 별도 다른 검사 없이도 3 genome detection(recipient + up to two donors)도 가능합니다.   

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5차례에 걸쳐 진행되었던 웨비나를 만나보세요!

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